Desde 1971 la sede de la UPD está ubicada  dentro de la antigua Facultad de medicina, creada en 1803 e instalada  en  el edificio del colegio y de la Academia de cirugía.

En el segundo piso del edificio, en una sala contruída en 1905, se encuentra el Museo de  Historia de la Medicina.

Las colecciones, las más antiguas de Europa, fueron reunidas por el decano Lafaye en el siglo XVII, luego se añadió un importante conjunto de piezas que abarca las diferentes ramas del arte operatorio hasta finales del siglo XIX. También se pueden descubrir allí algunos estuches  de cirujanos  así como instrumentos de fisiología